Seperti sekolah boarding pada umumnya, Hatoy memiliki keunikan tersendiri. Setidanya ada lima keunikan di SMA Hatoy, diantaranya:

1. Lingkungan Hatoy tidak berpagar. Biasanya calon santri baru terutama orang tuanya langsung berpikir kalau nantinya anakku bisa sering kabur
2. Lingkungan Hatoy yang hijau, asri, bernuansa hutan dan dikelilingi sungai-sungai. Sehingga dari asrama menuju ruangan kelas walau jarak hanya 150 meter santri harus melewati sungai
3. Ada tiga aturan disiplin yang super ketat di Hatoy. Sholat berjamaah, masuk kelas di pagi hari dan ketepatan masuk asrama ketika keluar pesantren atau pulang.
4. Guru-guru Hatoy keren-keren.Ada sarjana pertanian juaran nasional Matematika. Ada juara nasional Biologi ada Sarjana Biologi tapi juara sebagai guru Kimia, ada sarjana Komunikasi sebagai Ketua MGMP Sosiologi dan keunikan lainnya banyak guru juga sebagai ustadz atau kiyai. Dan satu lagi guru-guru Hatoy sangat dekat dan akrab dengan siswanya
5. Lulusan SMA Hatoy emang aneh.Ada yang melanjutkan ke Turki, Malaysia, Australia, Jerman sudah pasti kalau UI, ITB, UGM, IPB dan Unpad cukup banyak alumni bercokol disana....

Ini lho lima keunikan kami, gak percaya monggo kunjungi kami di Jalan Karamat Kota Sukabumi.